Безопасное удаление необязательного столбца в PostgreSQL 9+

Просто добавьте IF EXIST в используемый оператор DROP COLUMN:

ALTER TABLE targetTable DROP COLUMN
IF EXISTS targetColumn;

Можно также применить подход с IF EXISTS, который хорошо работает при выполнении миграции

DO $$
BEGIN
  IF EXISTS (
    SELECT column_name
    FROM information_schema.columns
    WHERE table_name = targetTable AND column_name = targetColumn
  ) THEN
    ALTER TABLE targetTable DROP COLUMN targetColumn;
  END IF;
END $$;